Сейчас предостаточно контор в Санкт-Петербурге, которые оказывают бухгалтерские услуги на аутсорсинге. То бишь по вызову, другими словами. В том числе, помогают и с подсчётом и пересчётом налогов. Возможно, у вас человеческий фактор сыграл и вы где-то ошиблись, может, программа дала сбой, в которой вы подсчёты ведёте. И я думаю, что вам стоит обратиться по поводу налоговой консультации в контору https://megaconsult.ru/tax . Они помогут не только найти недочёты в вашей работе, но и смогут помочь с возвратом переплаченных налогов.